iOS 5 gây khó dễ với ứng dụng Hệ điều hành iOS 5 đang gây khó dễ với một số ứng dụng. Chẳng hạn như với ứng dụng Google Voice, hay ứng dụng Instapaper. Hầu hết các vấn đề liên quan đến ứng dụng sẽ được giải quyết, tuy nhiên hiện tại nó vẫn là một sự cố. Pin yếu Có lẽ phàn nàn dai dẳng nhất về iPhone 4S là thời lượng pin rất kém so với iPhone 4. Một bài kiểm tra tổng thể trên iLounge.com đã cho thấy những hứa hẹn của Apple về thời lượng pin mạnh mẽ hơn của iPhone 4S dường như hơi quá lời, vì iPhone 4S hoạt động yếu hơn iPhone 4 trên mọi thước đo. Hiện tại, vẫn chưa rõ liệu vấn đề này có phải do phần cứng của máy (có thể là vì bộ vi xử lí A5), Siri hay do các tính năng mới của iOS 5 như Notification Center, iCloud và Find Friends. Dù gì đi nữa, người dùng cũng đã đưa ra lời nhận xét về pin yếu với iPhone 4S. Màn hình kém hơn iPhone 4 Một số người dùng đã lên các diễn đàn Apple Support để phàn nàn về các vấn đề màn hình của iPhone 4s. Có vẻ như màu trên iPhone 4 S không sắc nét lắm trên một số thiết bị iPhone 4S, khi so sánh với iPhone 4. Một bài đánh giá sơ bộ trên trang công nghệ This Is Mi Next cũng lưu ý sự khác biệt này, và cho biết màu trên iPhone 4S có xu hướng xanh hơn so với các thế hệ iPhone trước. Sự cố với camera Apple đã nhấn mạnh đến đặc điểm camera nâng cấp của iPhone 4S, tuy nhiên một số chủ đề trên diễn đàn Apple Support vẫn kêu ca về chức năng camera của iPhone 4S. Mặc dù camera chụp những bức ảnh đẹp hơn, nhưng nhiều người cho biết cửa chập sẽ không mở sau khi đã bật camera.
